Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
INO80Q9ULG1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms