Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV3Q9UKW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms