Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GGA1Q9UJY5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms