Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms