Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPUSD1Q9UJJ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms