Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms