Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRRQ9UBK8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRRQ9UBK8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms