Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms