Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH10Q9P2E7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms