Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLRF1Q9NZS2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLRF1Q9NZS2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms