Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP53Q9NZM5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms