Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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