Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN6Q9NWW5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLN6Q9NWW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms