Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCLQ9NW38 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCLQ9NW38 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FANCLQ9NW38 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
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