Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO28Q9NVF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO28Q9NVF7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms