Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms