Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL1Q9NSC2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms