Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms