Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF3Q9NR23 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms