Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPNPEP3Q9NQH7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPNPEP3Q9NQH7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPNPEP3Q9NQH7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms