Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ASCL3Q9NQ33 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms