Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTA1Q9NP79 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTA1Q9NP79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms