Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMX1Q9NP08 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMX1Q9NP08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms