Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms