Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4Q9HBW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms