Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHEJ1Q9H9Q4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms