Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVMER34-1Q9H9K5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms