Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF541Q9H0D2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms