Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR12Q9C0I1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms