Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPO4Q9C0E2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPO4Q9C0E2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.7 ms