Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CFAP74Q9C0B2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFAP74Q9C0B2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFAP74Q9C0B2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms