Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEF2Q9C093 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEF2Q9C093 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms