Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF1Q9BZW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF1Q9BZW5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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