Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM8Q9BZR9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms