Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YTHDF1Q9BYJ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms