Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms