Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAPERQ9BY12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAPERQ9BY12 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms