Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A2Q9BY10 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A2Q9BY10 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms