Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3Q9BXJ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms