Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC2P3Q9BVR0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC2P3Q9BVR0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms