Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHCHD7Q9BUK0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms