Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms