Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms