Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT3Q9BQG1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT3Q9BQG1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms