Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF25Q9BQ70 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms