Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN18Q99952 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms