Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRX2Q99811 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms