Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1Q99536 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms