Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CR12Q96Q35 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms