Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCEEQ96PE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCEEQ96PE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms